TRANSER S.A., cuenta con un Sistema de Gestión Integrado, unificando los criterios normativos que regulan  la Gestión de Calidad  (ISO 9001), la Gestión Ambiental (ISO 14001) la Gestión de Seguridad y Salud Ocupacional (OHSAS 18001) La Gestión de Control y Seguridad (Estándares BASC). Cada una de estas certificaciones son revisadas y evaluadas anualmente, garantizando su mantenimiento y la actividad de mejoramiento permanente de la organización.

Adicional a estos elementos de Mejoramiento, la TRANSER S.A. es evaluada anualmente bajo los estándares RUC. Para el año 2013 TRANSER S.A. ha obtenido 94 puntos sobre 100.